Protein–RNA interactions for Protein: P04444

Hbb-bh1, Hemoglobin subunit beta-H1, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh1P04444 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hbb-bh1P04444 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Hbb-bh1P04444 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Hbb-bh1P04444 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms