Protein–RNA interactions for Protein: P02340

Tp53, Cellular tumor antigen p53, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tp53P02340 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tp53P02340 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tp53P02340 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tp53P02340 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tp53P02340 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tp53P02340 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tp53P02340 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tp53P02340 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tp53P02340 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53P02340 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tp53P02340 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms