Protein–RNA interactions for Protein: P01863

Ighg, Ig gamma-2A chain C region, A allele, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IghgP01863 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IghgP01863 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
IghgP01863 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IghgP01863 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
IghgP01863 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IghgP01863 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IghgP01863 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IghgP01863 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IghgP01863 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IghgP01863 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IghgP01863 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
IghgP01863 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
IghgP01863 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IghgP01863 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IghgP01863 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IghgP01863 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IghgP01863 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
IghgP01863 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IghgP01863 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
IghgP01863 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
IghgP01863 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IghgP01863 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IghgP01863 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
IghgP01863 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IghgP01863 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
IghgP01863 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
IghgP01863 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IghgP01863 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
IghgP01863 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IghgP01863 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
IghgP01863 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IghgP01863 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
IghgP01863 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
IghgP01863 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IghgP01863 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IghgP01863 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
IghgP01863 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
IghgP01863 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IghgP01863 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IghgP01863 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IghgP01863 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IghgP01863 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IghgP01863 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
IghgP01863 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IghgP01863 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IghgP01863 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IghgP01863 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IghgP01863 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
IghgP01863 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IghgP01863 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IghgP01863 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
IghgP01863 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
IghgP01863 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IghgP01863 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IghgP01863 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IghgP01863 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IghgP01863 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.32■■□□□ 1
IghgP01863 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
IghgP01863 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IghgP01863 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IghgP01863 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
IghgP01863 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.31■■□□□ 1
IghgP01863 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
IghgP01863 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IghgP01863 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IghgP01863 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IghgP01863 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
IghgP01863 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
IghgP01863 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IghgP01863 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IghgP01863 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IghgP01863 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IghgP01863 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
IghgP01863 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IghgP01863 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
IghgP01863 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IghgP01863 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IghgP01863 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IghgP01863 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.27■■□□□ 1
IghgP01863 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
IghgP01863 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
IghgP01863 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
IghgP01863 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IghgP01863 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IghgP01863 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IghgP01863 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
IghgP01863 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IghgP01863 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
IghgP01863 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
IghgP01863 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IghgP01863 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
IghgP01863 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IghgP01863 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IghgP01863 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IghgP01863 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IghgP01863 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
IghgP01863 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IghgP01863 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
IghgP01863 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
IghgP01863 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms