Protein–RNA interactions for Protein: P01849

Tcra, T-cell receptor alpha chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcraP01849 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcraP01849 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcraP01849 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TcraP01849 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcraP01849 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcraP01849 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcraP01849 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcraP01849 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
TcraP01849 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcraP01849 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcraP01849 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcraP01849 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcraP01849 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TcraP01849 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcraP01849 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcraP01849 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcraP01849 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcraP01849 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcraP01849 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcraP01849 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcraP01849 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcraP01849 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcraP01849 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcraP01849 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcraP01849 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
TcraP01849 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcraP01849 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcraP01849 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcraP01849 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcraP01849 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcraP01849 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
TcraP01849 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcraP01849 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcraP01849 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
TcraP01849 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
TcraP01849 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcraP01849 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcraP01849 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcraP01849 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcraP01849 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcraP01849 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcraP01849 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcraP01849 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcraP01849 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcraP01849 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TcraP01849 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcraP01849 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcraP01849 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcraP01849 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcraP01849 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcraP01849 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcraP01849 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcraP01849 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TcraP01849 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TcraP01849 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcraP01849 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcraP01849 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcraP01849 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcraP01849 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcraP01849 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TcraP01849 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TcraP01849 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
TcraP01849 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcraP01849 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcraP01849 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcraP01849 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcraP01849 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcraP01849 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcraP01849 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcraP01849 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcraP01849 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TcraP01849 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcraP01849 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TcraP01849 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcraP01849 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcraP01849 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcraP01849 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcraP01849 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcraP01849 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcraP01849 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcraP01849 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TcraP01849 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcraP01849 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TcraP01849 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms