Protein–RNA interactions for Protein: P01748

Ig heavy chain V region 23, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01748 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01748 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01748 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01748 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01748 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
P01748 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
P01748 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01748 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01748 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01748 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01748 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
P01748 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01748 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01748 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
P01748 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
P01748 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01748 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01748 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01748 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01748 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01748 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01748 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
P01748 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01748 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01748 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01748 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01748 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01748 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01748 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01748 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
P01748 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01748 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01748 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01748 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01748 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01748 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01748 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
P01748 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01748 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01748 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
P01748 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01748 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01748 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01748 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01748 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01748 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
P01748 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01748 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01748 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01748 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01748 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01748 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01748 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01748 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
P01748 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01748 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01748 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01748 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01748 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01748 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01748 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
P01748 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01748 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01748 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01748 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
P01748 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01748 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01748 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
P01748 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
P01748 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
P01748 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01748 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01748 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01748 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01748 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01748 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01748 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01748 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
P01748 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01748 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01748 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01748 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01748 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01748 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01748 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01748 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01748 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01748 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01748 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
P01748 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01748 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01748 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
P01748 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
P01748 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01748 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01748 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01748 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P01748 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01748 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
P01748 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms