Protein–RNA interactions for Protein: P01723

Ig lambda-1 chain V region, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01723 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01723 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01723 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01723 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01723 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01723 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
P01723 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01723 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01723 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01723 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
P01723 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
P01723 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01723 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01723 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01723 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01723 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
P01723 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01723 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01723 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
P01723 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01723 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01723 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01723 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01723 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01723 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01723 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
P01723 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01723 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01723 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01723 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01723 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
P01723 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01723 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01723 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01723 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01723 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
P01723 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01723 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
P01723 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01723 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01723 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01723 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01723 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01723 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01723 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01723 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01723 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01723 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01723 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
P01723 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
P01723 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01723 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01723 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
P01723 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01723 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01723 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01723 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01723 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01723 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01723 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01723 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
P01723 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
P01723 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01723 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01723 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01723 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01723 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01723 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01723 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
P01723 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01723 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01723 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01723 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01723 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01723 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01723 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01723 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
P01723 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01723 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01723 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01723 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
P01723 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01723 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01723 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
P01723 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
P01723 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01723 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01723 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01723 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01723 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
P01723 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01723 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01723 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01723 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01723 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01723 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01723 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01723 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01723 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01723 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms