Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01672 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
P01672 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P01672 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01672 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01672 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01672 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01672 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01672 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01672 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01672 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01672 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P01672 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
P01672 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01672 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01672 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01672 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
P01672 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
P01672 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
P01672 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01672 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
P01672 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01672 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
P01672 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01672 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
P01672 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01672 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01672 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01672 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01672 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01672 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01672 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01672 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01672 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01672 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01672 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01672 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01672 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
P01672 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
P01672 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01672 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01672 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01672 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01672 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01672 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01672 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
P01672 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01672 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
P01672 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01672 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01672 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01672 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01672 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01672 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
P01672 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
P01672 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
P01672 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01672 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01672 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01672 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01672 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01672 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01672 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01672 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01672 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01672 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01672 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01672 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01672 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01672 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01672 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01672 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01672 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01672 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01672 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01672 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01672 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01672 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01672 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01672 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01672 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
P01672 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01672 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01672 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01672 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01672 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01672 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01672 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01672 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01672 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01672 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01672 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01672 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01672 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01672 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01672 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01672 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01672 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01672 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01672 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms