Protein–RNA interactions for Protein: P01659

Ig kappa chain V-III region TEPC 124, mousemouse

Predictions only

Length 112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01659 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01659 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
P01659 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01659 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01659 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01659 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01659 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01659 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01659 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
P01659 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
P01659 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01659 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01659 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
P01659 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01659 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01659 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01659 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01659 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01659 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
P01659 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01659 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01659 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01659 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01659 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01659 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01659 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01659 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01659 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
P01659 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01659 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01659 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01659 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
P01659 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01659 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01659 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01659 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01659 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
P01659 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
P01659 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01659 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01659 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01659 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01659 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
P01659 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01659 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01659 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
P01659 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01659 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01659 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01659 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
P01659 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01659 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01659 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01659 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01659 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01659 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01659 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01659 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01659 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01659 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01659 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
P01659 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01659 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01659 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01659 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01659 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01659 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01659 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01659 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01659 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01659 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
P01659 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01659 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01659 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01659 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
P01659 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
P01659 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01659 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01659 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01659 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01659 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
P01659 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01659 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01659 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01659 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01659 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01659 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01659 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01659 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01659 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
P01659 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01659 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01659 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01659 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01659 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01659 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
P01659 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01659 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01659 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
P01659 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 171.7 ms