Protein–RNA interactions for Protein: P01636

Ig kappa chain V-V region MOPC 149, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01636 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01636 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01636 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01636 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
P01636 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01636 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01636 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
P01636 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
P01636 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01636 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01636 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01636 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01636 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01636 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
P01636 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01636 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01636 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01636 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
P01636 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01636 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01636 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
P01636 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01636 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01636 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01636 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01636 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01636 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01636 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01636 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01636 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
P01636 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01636 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01636 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01636 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01636 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
P01636 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01636 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01636 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01636 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01636 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
P01636 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
P01636 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01636 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01636 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01636 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01636 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01636 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01636 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
P01636 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01636 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01636 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01636 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01636 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01636 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01636 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
P01636 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01636 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
P01636 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01636 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
P01636 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01636 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
P01636 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01636 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01636 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01636 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01636 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01636 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01636 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01636 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01636 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01636 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01636 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
P01636 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01636 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01636 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01636 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01636 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01636 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01636 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01636 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01636 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
P01636 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01636 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01636 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01636 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01636 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01636 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01636 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
P01636 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01636 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
P01636 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01636 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
P01636 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01636 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01636 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01636 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01636 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01636 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01636 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
P01636 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.4 ms