Protein–RNA interactions for Protein: O89116

Vti1a, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1A, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1aO89116 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vti1aO89116 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Vti1aO89116 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vti1aO89116 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.1 ms