Protein–RNA interactions for Protein: O89110

Casp8, Caspase-8, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp8O89110 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Casp8O89110 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Casp8O89110 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp8O89110 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Casp8O89110 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Casp8O89110 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp8O89110 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp8O89110 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Casp8O89110 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms