Protein–RNA interactions for Protein: O88792

F11r, Junctional adhesion molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F11rO88792 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F11rO88792 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F11rO88792 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F11rO88792 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F11rO88792 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
F11rO88792 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
F11rO88792 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F11rO88792 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F11rO88792 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
F11rO88792 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F11rO88792 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F11rO88792 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F11rO88792 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F11rO88792 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
F11rO88792 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F11rO88792 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F11rO88792 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F11rO88792 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F11rO88792 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F11rO88792 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F11rO88792 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F11rO88792 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F11rO88792 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F11rO88792 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
F11rO88792 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F11rO88792 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F11rO88792 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
F11rO88792 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
F11rO88792 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
F11rO88792 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F11rO88792 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
F11rO88792 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
F11rO88792 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
F11rO88792 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
F11rO88792 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
F11rO88792 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F11rO88792 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F11rO88792 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F11rO88792 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F11rO88792 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F11rO88792 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
F11rO88792 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
F11rO88792 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F11rO88792 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F11rO88792 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F11rO88792 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F11rO88792 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
F11rO88792 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
F11rO88792 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F11rO88792 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F11rO88792 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F11rO88792 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
F11rO88792 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F11rO88792 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F11rO88792 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F11rO88792 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
F11rO88792 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
F11rO88792 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F11rO88792 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F11rO88792 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F11rO88792 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F11rO88792 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
F11rO88792 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F11rO88792 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F11rO88792 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
F11rO88792 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
F11rO88792 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F11rO88792 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
F11rO88792 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F11rO88792 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
F11rO88792 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F11rO88792 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F11rO88792 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F11rO88792 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F11rO88792 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
F11rO88792 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F11rO88792 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F11rO88792 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
F11rO88792 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F11rO88792 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F11rO88792 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F11rO88792 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F11rO88792 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F11rO88792 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F11rO88792 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F11rO88792 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
F11rO88792 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F11rO88792 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
F11rO88792 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F11rO88792 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
F11rO88792 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F11rO88792 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F11rO88792 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F11rO88792 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F11rO88792 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F11rO88792 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F11rO88792 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F11rO88792 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F11rO88792 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
F11rO88792 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms