Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tom1O88746 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tom1O88746 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tom1O88746 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Tom1O88746 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tom1O88746 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tom1O88746 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tom1O88746 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Tom1O88746 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Tom1O88746 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
Tom1O88746 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tom1O88746 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Tom1O88746 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 186.7 ms