Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Hcn2O88703 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Hcn2O88703 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Hcn2O88703 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms