Protein–RNA interactions for Protein: O88552

Cldn2, Claudin-2, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn2O88552 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cldn2O88552 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cldn2O88552 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
Cldn2O88552 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Cldn2O88552 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms