Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CntfrO88507 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
CntfrO88507 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
CntfrO88507 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CntfrO88507 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CntfrO88507 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CntfrO88507 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CntfrO88507 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CntfrO88507 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CntfrO88507 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CntfrO88507 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CntfrO88507 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CntfrO88507 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CntfrO88507 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
CntfrO88507 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
CntfrO88507 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms