Protein–RNA interactions for Protein: O88485

Dync1i1, Cytoplasmic dynein 1 intermediate chain 1, mousemouse

Predictions only

Length 628 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dync1i1O88485 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Dync1i1O88485 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Dync1i1O88485 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Dync1i1O88485 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Dync1i1O88485 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms