Protein–RNA interactions for Protein: O88327

Ctnnal1, Alpha-catulin, mousemouse

Predictions only

Length 731 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnal1O88327 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ctnnal1O88327 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ctnnal1O88327 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ctnnal1O88327 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms