Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Gm10509O88255 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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Gm10509O88255 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Gm10509O88255 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Gm10509O88255 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Gm10509O88255 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
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Gm10509O88255 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Gm10509O88255 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm10509O88255 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Gm10509O88255 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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Gm10509O88255 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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