Protein–RNA interactions for Protein: O70493

Snx12, Sorting nexin-12, mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx12O70493 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Snx12O70493 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Snx12O70493 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Snx12O70493 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx12O70493 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Snx12O70493 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Snx12O70493 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms