Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nptx2O70340 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nptx2O70340 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nptx2O70340 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nptx2O70340 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nptx2O70340 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nptx2O70340 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nptx2O70340 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nptx2O70340 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nptx2O70340 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nptx2O70340 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nptx2O70340 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nptx2O70340 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nptx2O70340 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nptx2O70340 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nptx2O70340 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nptx2O70340 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Nptx2O70340 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms