Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Psmb5O55234 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Psmb5O55234 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Psmb5O55234 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms