Protein–RNA interactions for Protein: O55203

Ldb2, LIM domain-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldb2O55203 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ldb2O55203 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Ldb2O55203 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ldb2O55203 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ldb2O55203 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ldb2O55203 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Ldb2O55203 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb2O55203 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb2O55203 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb2O55203 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb2O55203 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb2O55203 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb2O55203 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb2O55203 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ldb2O55203 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb2O55203 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb2O55203 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb2O55203 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb2O55203 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb2O55203 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb2O55203 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb2O55203 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb2O55203 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ldb2O55203 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ldb2O55203 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ldb2O55203 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ldb2O55203 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ldb2O55203 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ldb2O55203 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Ldb2O55203 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ldb2O55203 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb2O55203 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb2O55203 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb2O55203 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb2O55203 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb2O55203 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb2O55203 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb2O55203 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb2O55203 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb2O55203 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb2O55203 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Ldb2O55203 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb2O55203 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ldb2O55203 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms