Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Nipsnap2O55126 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Nipsnap2O55126 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Nipsnap2O55126 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms