Protein–RNA interactions for Protein: O55125

Nipsnap1, Protein NipSnap homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap1O55125 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Nipsnap1O55125 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nipsnap1O55125 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nipsnap1O55125 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms