Protein–RNA interactions for Protein: O55091

Impact, Protein IMPACT, mousemouse

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ImpactO55091 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ImpactO55091 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ImpactO55091 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ImpactO55091 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ImpactO55091 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ImpactO55091 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ImpactO55091 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ImpactO55091 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ImpactO55091 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ImpactO55091 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ImpactO55091 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ImpactO55091 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ImpactO55091 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ImpactO55091 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ImpactO55091 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ImpactO55091 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms