Protein–RNA interactions for Protein: O54915

Nr1i2, Nuclear receptor subfamily 1 group I member 2, mousemouse

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1i2O54915 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Nr1i2O54915 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nr1i2O54915 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nr1i2O54915 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Nr1i2O54915 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms