Protein–RNA interactions for Protein: O54818

Tpd52l1, Tumor protein D53, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpd52l1O54818 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Tpd52l1O54818 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Tpd52l1O54818 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Tpd52l1O54818 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Tpd52l1O54818 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms