Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rab33bO35963 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rab33bO35963 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Rab33bO35963 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms