Protein–RNA interactions for Protein: O35906

Spib, Transcription factor Spi-B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SpibO35906 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SpibO35906 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SpibO35906 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SpibO35906 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SpibO35906 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SpibO35906 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SpibO35906 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SpibO35906 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SpibO35906 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
SpibO35906 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SpibO35906 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SpibO35906 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SpibO35906 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SpibO35906 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
SpibO35906 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SpibO35906 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SpibO35906 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
SpibO35906 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SpibO35906 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SpibO35906 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SpibO35906 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SpibO35906 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
SpibO35906 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SpibO35906 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SpibO35906 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SpibO35906 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SpibO35906 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
SpibO35906 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SpibO35906 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SpibO35906 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
SpibO35906 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
SpibO35906 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SpibO35906 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SpibO35906 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
SpibO35906 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SpibO35906 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
SpibO35906 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SpibO35906 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
SpibO35906 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SpibO35906 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
SpibO35906 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
SpibO35906 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
SpibO35906 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
SpibO35906 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SpibO35906 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SpibO35906 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SpibO35906 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SpibO35906 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SpibO35906 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SpibO35906 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SpibO35906 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SpibO35906 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SpibO35906 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SpibO35906 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SpibO35906 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SpibO35906 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24■■□□□ 1.43
SpibO35906 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SpibO35906 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SpibO35906 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SpibO35906 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SpibO35906 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SpibO35906 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SpibO35906 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SpibO35906 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SpibO35906 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SpibO35906 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SpibO35906 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SpibO35906 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SpibO35906 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SpibO35906 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SpibO35906 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SpibO35906 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SpibO35906 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SpibO35906 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SpibO35906 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SpibO35906 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SpibO35906 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SpibO35906 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
SpibO35906 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SpibO35906 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SpibO35906 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SpibO35906 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SpibO35906 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SpibO35906 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SpibO35906 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SpibO35906 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SpibO35906 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SpibO35906 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SpibO35906 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SpibO35906 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SpibO35906 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SpibO35906 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SpibO35906 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SpibO35906 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SpibO35906 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SpibO35906 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SpibO35906 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SpibO35906 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SpibO35906 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SpibO35906 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57 ms