Protein–RNA interactions for Protein: O35711

Ppfibp2, Liprin-beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp2O35711 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Ppfibp2O35711 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ppfibp2O35711 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ppfibp2O35711 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ppfibp2O35711 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.8 ms