Protein–RNA interactions for Protein: O35448

Ppt2, Lysosomal thioesterase PPT2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppt2O35448 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ppt2O35448 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ppt2O35448 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms