Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Xbp1O35426 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Xbp1O35426 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Xbp1O35426 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.3 ms