Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC33.99■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Polr1aO35134 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Polr1aO35134 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Polr1aO35134 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC33.82■■■■□ 3
Polr1aO35134 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Polr1aO35134 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Polr1aO35134 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Polr1aO35134 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC33.81■■■■□ 3
Polr1aO35134 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Polr1aO35134 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
Polr1aO35134 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Polr1aO35134 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Polr1aO35134 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Polr1aO35134 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Polr1aO35134 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
Polr1aO35134 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Polr1aO35134 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Polr1aO35134 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Polr1aO35134 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
Polr1aO35134 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Polr1aO35134 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Polr1aO35134 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Polr1aO35134 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Polr1aO35134 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Polr1aO35134 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
Polr1aO35134 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Polr1aO35134 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Polr1aO35134 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Polr1aO35134 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC33.77■■■■□ 3
Polr1aO35134 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Polr1aO35134 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Polr1aO35134 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Polr1aO35134 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
Polr1aO35134 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms