Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfra3O35118 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfra3O35118 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfra3O35118 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Gfra3O35118 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gfra3O35118 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gfra3O35118 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.9 ms