Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
ArxO35085 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
ArxO35085 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
ArxO35085 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
ArxO35085 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
ArxO35085 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26,75■■□□□ 1,87
ArxO35085 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC26,75■■□□□ 1,87
ArxO35085 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC26,74■■□□□ 1,87
ArxO35085 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
ArxO35085 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26,74■■□□□ 1,87
ArxO35085 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
ArxO35085 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
ArxO35085 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26,74■■□□□ 1,87
ArxO35085 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
ArxO35085 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
ArxO35085 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
ArxO35085 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
ArxO35085 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,73■■□□□ 1,87
ArxO35085 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
ArxO35085 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
ArxO35085 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
ArxO35085 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
ArxO35085 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
ArxO35085 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
ArxO35085 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
ArxO35085 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
ArxO35085 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
ArxO35085 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
ArxO35085 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
ArxO35085 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
ArxO35085 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
ArxO35085 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,71■■□□□ 1,87
ArxO35085 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
ArxO35085 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
ArxO35085 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
ArxO35085 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,87
ArxO35085 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
ArxO35085 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
ArxO35085 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26,7■■□□□ 1,86
ArxO35085 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,7■■□□□ 1,86
ArxO35085 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
ArxO35085 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
ArxO35085 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC26,69■■□□□ 1,86
ArxO35085 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC26,69■■□□□ 1,86
ArxO35085 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
ArxO35085 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
ArxO35085 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
ArxO35085 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
ArxO35085 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC26,68■■□□□ 1,86
ArxO35085 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
ArxO35085 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26,68■■□□□ 1,86
ArxO35085 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,68■■□□□ 1,86
ArxO35085 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
ArxO35085 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC26,67■■□□□ 1,86
ArxO35085 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
ArxO35085 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
ArxO35085 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26,66■■□□□ 1,86
ArxO35085 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
ArxO35085 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
ArxO35085 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,66■■□□□ 1,86
ArxO35085 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
ArxO35085 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
ArxO35085 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
ArxO35085 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
ArxO35085 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC26,64■■□□□ 1,86
ArxO35085 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC26,64■■□□□ 1,86
ArxO35085 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
ArxO35085 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
ArxO35085 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,63■■□□□ 1,85
ArxO35085 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,63■■□□□ 1,85
ArxO35085 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
ArxO35085 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26,62■■□□□ 1,85
ArxO35085 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
ArxO35085 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
ArxO35085 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
ArxO35085 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
ArxO35085 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC26,62■■□□□ 1,85
ArxO35085 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
ArxO35085 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26,62■■□□□ 1,85
ArxO35085 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
ArxO35085 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
ArxO35085 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
ArxO35085 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
ArxO35085 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
ArxO35085 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26,61■■□□□ 1,85
ArxO35085 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
ArxO35085 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
ArxO35085 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC26,6■■□□□ 1,85
ArxO35085 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
ArxO35085 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC26,6■■□□□ 1,85
ArxO35085 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
ArxO35085 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
ArxO35085 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26,6■■□□□ 1,85
ArxO35085 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26,6■■□□□ 1,85
ArxO35085 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26,59■■□□□ 1,85
ArxO35085 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
ArxO35085 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
ArxO35085 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,85
ArxO35085 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
ArxO35085 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,58■■□□□ 1,84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24,2 ms