Protein–RNA interactions for Protein: O08532

Cacna2d1, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d1O08532 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Cacna2d1O08532 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cacna2d1O08532 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Cacna2d1O08532 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Cacna2d1O08532 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms