Protein–RNA interactions for Protein: M0QW46

Ascl4, Achaete-scute family bHLH transcription factor 4, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl4M0QW46 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ascl4M0QW46 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ascl4M0QW46 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ascl4M0QW46 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms