Protein–RNA interactions for Protein: J3QPE5

Gm5849, Predicted gene 5849, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5849J3QPE5 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm5849J3QPE5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gm5849J3QPE5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gm5849J3QPE5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms