Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm21972J3QN38 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm21972J3QN38 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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Gm21972J3QN38 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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Gm21972J3QN38 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Gm21972J3QN38 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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