Protein–RNA interactions for Protein: G3X9N3

Pnmal2, MCG16539, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnmal2G3X9N3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC26.51■■□□□ 1.84
Pnmal2G3X9N3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pnmal2G3X9N3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Pnmal2G3X9N3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pnmal2G3X9N3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms