Protein–RNA interactions for Protein: G3X939

Slc9a3, Sodium/hydrogen exchanger 3, mousemouse

Predictions only

Length 829 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a3G3X939 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Slc9a3G3X939 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Slc9a3G3X939 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Slc9a3G3X939 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms