Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Speer4cG3UXD1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Speer4cG3UXD1 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Speer4cG3UXD1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms