Protein–RNA interactions for Protein: F6Z6Z2

3110082J24Rik, RIKEN cDNA 3110082J24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3110082J24RikF6Z6Z2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
3110082J24RikF6Z6Z2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
3110082J24RikF6Z6Z2 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
3110082J24RikF6Z6Z2 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
3110082J24RikF6Z6Z2 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
3110082J24RikF6Z6Z2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 310.8 ms