Protein–RNA interactions for Protein: F6QRE9

Erich3, Glutamate-rich 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erich3F6QRE9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
Erich3F6QRE9 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
Erich3F6QRE9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Erich3F6QRE9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Erich3F6QRE9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Erich3F6QRE9 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms