Protein–RNA interactions for Protein: E9QAU8

Rnf165, E3 ubiquitin-protein ligase RNF165, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf165E9QAU8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.45■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Rnf165E9QAU8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Rnf165E9QAU8 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Rnf165E9QAU8 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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