Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P1

Col22a1, Collagen, type XXII, alpha 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col22a1E9Q7P1 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Col22a1E9Q7P1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Col22a1E9Q7P1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Col22a1E9Q7P1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Col22a1E9Q7P1 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Col22a1E9Q7P1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 396.4 ms