Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
ApobE9Q414 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
ApobE9Q414 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms