Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1F5

Myo5c, Myosin VC, mousemouse

Predictions only

Length 1,742 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myo5cE9Q1F5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC31.29■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.28■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC31.27■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
Myo5cE9Q1F5 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC31.26■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC31.25■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC31.22■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Myo5cE9Q1F5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC31.2■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC31.16■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC31.16■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
Myo5cE9Q1F5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC31.12■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Myo5cE9Q1F5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
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