Protein–RNA interactions for Protein: E9PXF8

Sbf2, SET-binding factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sbf2E9PXF8 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sbf2E9PXF8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sbf2E9PXF8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Sbf2E9PXF8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sbf2E9PXF8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sbf2E9PXF8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Sbf2E9PXF8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms